El hecho de que Cadaqués esté orientado al mar y separado de la comarca del Alto Ampurdán por la montaña de Pení repercute directamente sobre el clima de este municipio y claro, este hecho lo diferencia del resto de poblaciones. Además, por su proximidad con Francia el clima de Cadaqués es muy similar al de este país. Por eso, antes de poner rumbo a Cadaqués, es aconsejable consultar la meteorología francesa, ya que esta es la que más se aproxima al tiempo que hace en el pueblo.
En general Cadaqués goza de un clima temperado y soleado, típico de los países mediterráneos con inviernos más o menos fríos y con temperaturas, el resto del año, generalmente agradables.
Un elemento habitual en esta región es la tramontana, viento muy fuerte que puede alcanzar velocidades de más de 100 k/m, especialmente en la zona del Cabo de Creus, donde se han registrado velocidades de fuerza superior, provocando incluso desperfectos en el faro del Cabo de Creus.
A veces, la tramontana sopla unos días y en ocasiones incluso una semana entera.
En cada mata, árbol, piedra o roca podemos apreciar el efecto de la tramontana que desde tiempos inmemoriales ha ido esculpiendo las formas de este singular paisaje. Y es que el viento es una fuerza natural muy presente en todo el territorio.